Probiotici pomažu u uspostavljanju ravnoteže (između tzv. “dobrih i loših” bakterija) u našim crijevima, jer mikroflora može postati poremećena uslijed bolesti, stresa, starenja, uzimanja antibiotika ili drugih lijekova, izlaganja toksinima, prekomjernoj konzumaciji alkohola, te čak i kod korištenja antibakterijskih sapuna. Probiotičke vrste kompetitivno inhibiraju stvaranje toksičnih supstancija i rast manje poželjnih vrsta natječući se za prostor i hranu.

Osim što štite probavu i jačaju imunitet, probiotici su, prema posljednjim istraživanjima, ujedno i djelotvorna pomoć organizmu u borbi protiv depresije, anksioznosti i straha. Pokazuje to  istraživanje koje su proveli znanstvenici Sveučilišta u Torontu, na četrdesetak pacijenata oboljelih od hroničnog umora.